Die Züge von und nach New York City werden meist von den vielen Pendlern genutzt, die morgens in Massen aus den Bahnhöfen schwärmen, um in der Stadt zu arbeiten. Die Hudson Line läuft entlang des Hudson Rivers bis nach Poughkeepsie. Andere Linien fahren ins Landesinnere wie die Port Jervis Line, Pascack Valley Line oder die Harlem Line.
So fährt z.B. die Long Island Railroad (LIRR) zwischen der Penn Station in Manhattan und Long Island. Die Metro North Railroad hat mehrere Linien. So Fährt die New Haven Line von der Penn Station und Harlem die Küste entlang bis zum Ort New Haven.
Die Staten Island Railway verbindet die Insel Staten Island, die über die Verrazano-Narrows-Brücke von Brooklyn aus erreichbar ist, mit der Ostküste.
